Vorlesung und Übung: Biophysikalische und Angewandte Aspekte der Bioinformatik/Biophysical and Applied Bioinformatics [PHY-BPHBI-15] - Details

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Allgemeine Informationen

Veranstaltungsname Vorlesung und Übung: Biophysikalische und Angewandte Aspekte der Bioinformatik/Biophysical and Applied Bioinformatics [PHY-BPHBI-15]
Untertitel
Veranstaltungsnummer 4.466
Semester WiSe 2021/22
Aktuelle Anzahl der Teilnehmenden 13
erwartete Teilnehmendenanzahl 40
Heimat-Einrichtung Institut für Physik
beteiligte Einrichtungen Fachbereich 5: Biologie/Chemie, Institut für Chemie neuer Materialien
Veranstaltungstyp Vorlesung und Übung in der Kategorie Offizielle Lehrveranstaltungen
Erster Termin Freitag, 22.10.2021 14:00 - 16:00, Ort: 32/214
Art/Form
SWS 2
Sprache deutsch oder englisch
Hinweise zur Veranstaltung EBioinformatics lectures will begin on 10/22/2021. The lectures will be made available online as OpenCast video clips. The first lecture will be available early in the morning of 10/22/2021. In the first clip, I will explain how we will proceed with lectures, practicals, and seminars this semester. On the same day, I will be present in room 32/214 of the Physics Department starting from 14:15 for anyone who wants to ask questions. Throughout the semester, I will be available via the BigBlueButton during the lecture time.


Die Vorlesungen in Bioinformatik werden am 22.10.2021 beginnen. Die Vorlesungen werden online als OpenCast-Videoclips zur Verfügung gestellt. Die erste Vorlesung wird am Morgen des 22.10.2021 verfügbar sein. Im ersten Clip werde ich erklären, wie wir in diesem Semester mit Vorlesungen, Übungen und Seminaren vorgehen werden. Am selben Tag werde ich ab 14:15 Uhr im Raum 32/214 des Fachbereichs Physik für alle, die Fragen stellen möchten, anwesend sein. Während des gesamten Semesters werde ich während der Vorlesungszeit über den BigBlueButton erreichbar sein.
Sonstiges Bereich: wissenschaftliche Veranstaltung
ECTS-Punkte 6,00

Räume und Zeiten

32/214
Freitag: 14:00 - 16:00, wöchentlich (14x)
Freitag: 16:00 - 18:00, wöchentlich (14x)

Studienbereiche

Kommentar/Beschreibung

Die Veranstaltung ist für Studenten ohne Informatik-Vorkenntnisse konzipiert und ist für Studiengänge Advanced Physics und Nanoscience angeboten. Die Veranstaltung kann auch als nützliche Ergänzung zum Biologie-Curriculum betrachtet werden. Sie ist für Biologen geeignet (ab 5. Semester) und kann als "Schlüsselqualifikation" anerkannt werden.

The course is designed for students with no informatics skills and is offered for Advanced Physics and Nanoscience degree programs. The course is a useful supplement to the biology curriculum. It is suitable for biologists (from the 5th semester) and can be recognized as a "key qualification".

Teaching topics: Structure of biological macromolecules with a focus on functionally relevant properties of amino acid residues, pairwise and multiple sequence alignments, biological databases, sequence searches with the BLAST and PSI-BLAST algorithms, phylogenetic trees. The students will learn both the biological basics and the tools of bioinformatics. The ultimate task is to teach the students to mine the necessary biological information without time-consuming experiments, only through database analysis.


Unterrichts-Themen: Struktur der biologischen Makromoleküle mit einem Schwerpunkt auf funktionsrelevanten Eigenschaften von Aminosäure-Resten, paarweise und multiple Sequenzvergleiche, Abfragen biologischer Datenbanken, Sequenzsuchen mit den BLAST-und PSI-BLAST Algorithmen, Erstellung phylogenetischer Bäume. Die Studenten werden sowohl die biologischen Grundlagen, als auch die Werkzeuge der Bioinformatik erlernen. Praktische Arbeiten werden helfen, das Gelernte zu vertiefen und zu üben, die notwendige biologische Information ohne zeitraubende Experimente nur durch Datenbank-Analyse zu gewinnen.